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系统生物学根植于'''<font color="#FF8000">酶动力学 enzyme kinetics</font>'''的定量模型（酶动力学在1900年到1970年间蓬勃发展）、'''<font color="#FF8000">种群动力学 population dynamics</font>'''的数学模型、神经生理学模拟、控制理论和'''<font color="#FF8000">控制论 control theory</font>'''以及'''<font color="#FF8000">协同学 Synergetics</font>'''。
系统生物学根植于'''<font color="#FF8000">酶动力学 enzyme kinetics</font>'''的定量模型（酶动力学在1900年到1970年间蓬勃发展）、'''<font color="#FF8000">种群动力学 population dynamics</font>'''的数学模型、神经生理学模拟、控制理论和'''<font color="#FF8000">控制论 control theory</font>'''以及'''<font color="#FF8000">协同学 Synergetics</font>'''。
理论家卡尔·路德维希·冯·贝塔郎非 Carl Ludwig von Betarronfe和他的<font color="#FF8000">一般系统论 general systems theory</font>可以被看作是系统生物学先驱之一。英国神经生理学家、诺贝尔奖获得者艾伦•劳埃德•霍奇金 Alan Lloyd Hodgkin和安德鲁•费尔丁•赫克斯利 Andrew Ferdinand Hoxley在1952年发表了最早的细胞生物学的数理分析之一，他们也创建了一个数学模型，解释了沿神经元细胞轴突传播的动作电位。他们的模型描述了一种由钾和钠两种不同的分子成分之间的相互作用所产生的细胞功能，所以这可以被看作是演算系统生物学的开端。无独有偶，艾伦•图灵 Alan Turing在1952年发表了形态发生的化学基础，描述了最初同质的生物系统中是如何产生不均匀性的。<ref>{{Cite journal|last1=Turing|first1=A. M.|authorlink=Alan Turing|title=The Chemical Basis of Morphogenesis|journal=Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences|volume=237|issue=641|pages=37–72|doi=10.1098/rstb.1952.0012|url=http://www.dna.caltech.edu/courses/cs191/paperscs191/turing.pdf|jstor=92463|year=1952|pmid=|pmc =|bibcode=1952RSPTB.237...37T}}</ref>
理论家卡尔·路德维希·冯·贝塔郎非 Carl Ludwig von Betarronfe和他的'''<font color="#FF8000">一般系统论 general systems theory</font>'''可以被看作是系统生物学先驱之一。英国神经生理学家、诺贝尔奖获得者艾伦•劳埃德•霍奇金 Alan Lloyd Hodgkin和安德鲁•费尔丁•赫克斯利 Andrew Ferdinand Hoxley在1952年发表了最早的细胞生物学的数理分析之一，他们也创建了一个数学模型，解释了沿神经元细胞轴突传播的动作电位。他们的模型描述了一种由钾和钠两种不同的分子成分之间的相互作用所产生的细胞功能，所以这可以被看作是演算系统生物学的开端。无独有偶，艾伦•图灵 Alan Turing在1952年发表了形态发生的化学基础，描述了最初同质的生物系统中是如何产生不均匀性的。<ref>{{Cite journal|last1=Turing|first1=A. M.|authorlink=Alan Turing|title=The Chemical Basis of Morphogenesis|journal=Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences|volume=237|issue=641|pages=37–72|doi=10.1098/rstb.1952.0012|url=http://www.dna.caltech.edu/courses/cs191/paperscs191/turing.pdf|jstor=92463|year=1952|pmid=|pmc =|bibcode=1952RSPTB.237...37T}}</ref>
1960年，Dennis Noble创建了第一个心脏起搏器的计算模型。
1960年，Dennis Noble创建了第一个心脏起搏器的计算模型。