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除了空间上的权衡，不同的数据结构也有着不同的操作。在邻接表中找到与给定顶点相邻的所有顶点就像读取邻接表一样简单。对于邻接矩阵，必须扫描整行，这需要花费O(|V|) 的时间。给定的两个顶点之间是否有边可以用邻接矩阵一次确定，并且运行时间与邻接列表中两个顶点的最小度数成正比。

除了空间上的权衡，不同的数据结构也有着不同的操作。在邻接表中找到与给定顶点相邻的所有顶点就像读取邻接表一样简单。对于邻接矩阵，必须扫描整行，这需要花费<math>O(|V|）</math>的时间。给定的两个顶点之间是否有边可以用邻接矩阵一次确定，并且运行时间与邻接列表中两个顶点的最小度数成正比。

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