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[[File:Oxiphos.png|thumb|left|upright=1.25|氧化磷酸化]]
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[[File:Chemiosmotic_coupling mitochondrion.gif|thumb|left|upright=1.25|化学渗透耦合线粒体]]
[[File:Chemiosmotic coupling mitochondrion.gif|thumb|left|upright=1.25|化学渗透耦合线粒体]]
由于在1970年左右发酵已经被阐明，而氧化磷酸化的机制还没有，而且存在一些争议，所以发酵作用在当时对生命起源的研究者来说可能显得过于复杂。不过，彼得·米切尔 Peter Mitchell的化学渗透现在被普遍接受是正确的。
由于在1970年左右发酵已经被阐明，而氧化磷酸化的机制还没有，而且存在一些争议，所以发酵作用在当时对生命起源的研究者来说可能显得过于复杂。不过，彼得·米切尔 Peter Mitchell的化学渗透现在被普遍接受是正确的。
===系统发育和最后的普遍共同祖先===
===系统发育和最后的普遍共同祖先===
[[File:Phylogenic Tree-en.svg.png|upright=1.65|thumb|一个描述出现在生命系统发育树基部的火山热泉中的极端超嗜热菌的进化分枝图。]]
[[File:Phylogenic Tree-en.svg.png|upright=1.65|thumb|一个描述出现在生命系统发育树基部的火山热泉中的极端超嗜热菌的进化分枝图。]]
根据从卡尔·沃斯 Carl Woese 开始的一些分子研究，对于生命树的根部的位置，最普遍接受的观点是位于单系域细菌和一个由古细菌和真核生物组成的演化枝之间，这被称为“传统生命树”。<ref>{{cite book |editor1-first=David R. |editor1-last=Boone |editor2-first=Richard W. |editor2-last=Castenholz |editor3-first=George M. |editor3-last=Garrity |title=The ''Archaea'' and the Deeply Branching and Phototrophic ''Bacteria'' |series=Bergey's Manual of Systematic Bacteriology |isbn=978-0-387-21609-6 |url=https://www.springer.com/life+sciences/microbiology/book/978-0-387-98771-2 |url-status=live |archiveurl=https://web.archive.org/web/20141225112809/http://www.springer.com/life+sciences/microbiology/book/978-0-387-98771-2 |archivedate=25 December 2014|publisher=Springer |year=2001 }}{{page needed|date=June 2014}}</ref><ref>{{cite journal |vauthors=Woese CR, Fox GE |title= Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms. |journal= Proc Natl Acad Sci U S A |volume=74|pages= 5088–5090 |year=1977 |issue= 11 |pmid=270744 |pmc=432104|doi=10.1073/pnas.74.11.5088|bibcode= 1977PNAS...74.5088W }}</ref>
根据从卡尔·沃斯 Carl Woese 开始的一些分子研究，对于生命树的根部的位置，最普遍接受的观点是位于单系域细菌和一个由古细菌和真核生物组成的演化枝之间，这被称为“传统生命树”。<ref>{{cite book |editor1-first=David R. |editor1-last=Boone |editor2-first=Richard W. |editor2-last=Castenholz |editor3-first=George M. |editor3-last=Garrity |title=The ''Archaea'' and the Deeply Branching and Phototrophic ''Bacteria'' |series=Bergey's Manual of Systematic Bacteriology |isbn=978-0-387-21609-6 |url=https://www.springer.com/life+sciences/microbiology/book/978-0-387-98771-2 |url-status=live |archiveurl=https://web.archive.org/web/20141225112809/http://www.springer.com/life+sciences/microbiology/book/978-0-387-98771-2 |archivedate=25 December 2014|publisher=Springer |year=2001 }}{{page needed|date=June 2014}}</ref><ref>{{cite journal |vauthors=Woese CR, Fox GE |title= Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms. |journal= Proc Natl Acad Sci U S A |volume=74|pages= 5088–5090 |year=1977 |issue= 11 |pmid=270744 |pmc=432104|doi=10.1073/pnas.74.11.5088|bibcode= 1977PNAS...74.5088W }}</ref>
===生物发生中的关键问题===
===生物发生中的关键问题===
====孰先孰后：蛋白质还是核酸？====
====孰先孰后：蛋白质还是核酸？====