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这种类型的网络存在于多个调节子结合起来控制一组基因的情形,并且有多种调控的组合。这种模体出现在[[大肠杆菌]]的多种系统中,例如碳利用、厌氧生长、应激反应等。<ref name="she1"/><ref name="boy1"/> 为了更好地理解这种网络,我们必须得到关于基因集成多种输入的方式的信息。Kaplan ''et al.''<ref name="kap2">{{cite journal |vauthors=Kaplan S, Bren A, Zaslaver A, Dekel E, Alon U |title=Diverse two-dimensional input functions control bacterial sugar genes |journal=Mol. Cell |volume=29 |issue=6 |pages=786–92 |date=March 2008 |pmid=18374652 |pmc=2366073 |doi=10.1016/j.molcel.2008.01.021 }}</ref>绘制了[[大肠杆菌]]糖利用基因的输入函数,表现出各种各样的形状。
 
这种类型的网络存在于多个调节子结合起来控制一组基因的情形,并且有多种调控的组合。这种模体出现在[[大肠杆菌]]的多种系统中,例如碳利用、厌氧生长、应激反应等。<ref name="she1"/><ref name="boy1"/> 为了更好地理解这种网络,我们必须得到关于基因集成多种输入的方式的信息。Kaplan ''et al.''<ref name="kap2">{{cite journal |vauthors=Kaplan S, Bren A, Zaslaver A, Dekel E, Alon U |title=Diverse two-dimensional input functions control bacterial sugar genes |journal=Mol. Cell |volume=29 |issue=6 |pages=786–92 |date=March 2008 |pmid=18374652 |pmc=2366073 |doi=10.1016/j.molcel.2008.01.021 }}</ref>绘制了[[大肠杆菌]]糖利用基因的输入函数,表现出各种各样的形状。
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==活动模体/Activity motifs==
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==活动模体==
An interesting generalization of the network-motifs, '''activity motifs''' are over occurring patterns that can be found when nodes and edges in the network are annotated with quantitative features. For instance, when edges in a metabolic pathways are annotated with the magnitude or timing of the corresponding gene expression, some patterns are over occurring '''given''' the underlying network structure.<ref name="agc">{{cite journal |vauthors=Chechik G, Oh E, Rando O, Weissman J, Regev A, Koller D |title=Activity motifs reveal principles of timing in transcriptional control of the yeast metabolic network |journal=Nat. Biotechnol. |volume=26 |issue=11 |pages=1251–9 |date=November 2008 |pmid=18953355 |pmc=2651818 |doi=10.1038/nbt.1499}}</ref>
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关于网络模体有一个有趣的概括:
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关于网络模体有一个有趣的概括:'''活动模体'''是在对节点和边都被量化标准的网络中可发现的【反复】的斑图。例如,当新城代谢的边以相应基因的表达量或【时间】来标注时,一些斑图在'''给定的'''底层网络结构里【是反复的】。<ref name="agc">{{cite journal |vauthors=Chechik G, Oh E, Rando O, Weissman J, Regev A, Koller D |title=Activity motifs reveal principles of timing in transcriptional control of the yeast metabolic network |journal=Nat. Biotechnol. |volume=26 |issue=11 |pages=1251–9 |date=November 2008 |pmid=18953355 |pmc=2651818 |doi=10.1038/nbt.1499}}</ref>
在一个对节点(node)和边(edge)以量化标注的网络中,'''活动模体'''是【反复】的斑图。例如,当新城代谢的边以相应基因的表达量或【时间】来标注时,一些斑图在'''给定的'''底层网络结构里【是反复的】。<ref name="agc">{{cite journal |vauthors=Chechik G, Oh E, Rando O, Weissman J, Regev A, Koller D |title=Activity motifs reveal principles of timing in transcriptional control of the yeast metabolic network |journal=Nat. Biotechnol. |volume=26 |issue=11 |pages=1251–9 |date=November 2008 |pmid=18953355 |pmc=2651818 |doi=10.1038/nbt.1499}}</ref>
      
==批判 Criticism==
 
==批判 Criticism==
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