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大小无更改 、 2024年8月25日 (星期日)
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===在生物系统上的应用===
 
===在生物系统上的应用===
进一步,Klein等人将[[复杂网络上的因果涌现]]方法扩展到了更多的生物网络中。前文已经指出,[[生物网络]]具有更大的噪音,这使得我们很难理解其内部的运作原理,这种噪音一方面来自系统的固有噪音,另一方面是由于测量或观察引入的。Klein等<ref>Klein B, Swain A, Byrum T, et al. Exploring noise, degeneracy and determinism in biological networks with the einet package[J]. Methods in Ecology and Evolution, 2022, 13(4): 799-804.</ref>进一步探索了生物网络中的噪声、[[简并性]]和[[确定性]]三者之间的关系以及具体含义,得出了一些有趣的结论。
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进一步,Klein等人将[[复杂网络中的因果涌现]]方法扩展到了更多的生物网络中。前文已经指出,[[生物网络]]具有更大的噪音,这使得我们很难理解其内部的运作原理,这种噪音一方面来自系统的固有噪音,另一方面是由于测量或观察引入的。Klein等<ref>Klein B, Swain A, Byrum T, et al. Exploring noise, degeneracy and determinism in biological networks with the einet package[J]. Methods in Ecology and Evolution, 2022, 13(4): 799-804.</ref>进一步探索了生物网络中的噪声、[[简并性]]和[[确定性]]三者之间的关系以及具体含义,得出了一些有趣的结论。
    
例如,基因表达网络中的高[[确定性]]可以理解为一个基因几乎肯定会导致另一个基因的表达。同时生物系统在进化过程中也普遍存在高[[简并性]]现象。这两个因素共同导致,目前人们尚不清楚应该在何种尺度上分析生物系统才能最好地理解它们的功能。Klein等<ref>Klein B, Hoel E, Swain A, et al. Evolution and emergence: higher order information structure in protein interactomes across the tree of life[J]. Integrative Biology, 2021, 13(12): 283-294.</ref>分析了超过1800个物种的[[蛋白质相互作用网络]],发现宏观尺度的网络具有更小的噪音和[[简并性]],同时与不参与宏观尺度的节点相比,组成宏观尺度交互群中的节点更具有弹性。因此,生物网络为了适应进化的要求,需要演化出宏观尺度以提高确定性来增强[[网络弹性]]以及提高信息传输的有效性。
 
例如,基因表达网络中的高[[确定性]]可以理解为一个基因几乎肯定会导致另一个基因的表达。同时生物系统在进化过程中也普遍存在高[[简并性]]现象。这两个因素共同导致,目前人们尚不清楚应该在何种尺度上分析生物系统才能最好地理解它们的功能。Klein等<ref>Klein B, Hoel E, Swain A, et al. Evolution and emergence: higher order information structure in protein interactomes across the tree of life[J]. Integrative Biology, 2021, 13(12): 283-294.</ref>分析了超过1800个物种的[[蛋白质相互作用网络]],发现宏观尺度的网络具有更小的噪音和[[简并性]],同时与不参与宏观尺度的节点相比,组成宏观尺度交互群中的节点更具有弹性。因此,生物网络为了适应进化的要求,需要演化出宏观尺度以提高确定性来增强[[网络弹性]]以及提高信息传输的有效性。
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