第92行: |
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| # 初始化一个节点的集合[math]V[/math],将[math]V[/math]中的每个节点所属的[[马尔可夫毯]]也加入集合中; | | # 初始化一个节点的集合[math]V[/math],将[math]V[/math]中的每个节点所属的[[马尔可夫毯]]也加入集合中; |
| # 遍历[math]G[/math]中的节点<math>\{v_i\}_{i=1}^N</math>(如果节点已经被合并成宏观节点则跳过),直到所有的节点遍历一遍停止: | | # 遍历[math]G[/math]中的节点<math>\{v_i\}_{i=1}^N</math>(如果节点已经被合并成宏观节点则跳过),直到所有的节点遍历一遍停止: |
− | # 初始化一个队列<math>Q</math>, 取出集合V中<math>v_i</math>对应的邻域,将其加入队列中; | + | # 初始化一个队列<math>Q</math>, 取出集合V中<math>v_i</math>对应的马尔可夫毯,将其加入队列中; |
| # 初始时<math>v_{\mu}</math>=<math>v_i</math>, | | # 初始时<math>v_{\mu}</math>=<math>v_i</math>, |
| # 分别尝试将 <math>v_{\mu}</math> 与 <math>v_j</math><math>\in Q</math>合并: | | # 分别尝试将 <math>v_{\mu}</math> 与 <math>v_j</math><math>\in Q</math>合并: |
− | ## 如果合并后的网络的EI增加了,就将这两个节点合并组成新的宏观节点<math>v_{\mu}</math>,得到宏观网络<math>B</math>,将<math>v_j</math>所属的邻域中的不在队列中的节点加入队列中,更新集合中节点的邻域,如果节点邻域中包括<math>v_j</math>节点,则将<math>v_j</math>节点去除 | + | ## 如果合并后的网络的EI增加了,就将这两个节点合并组成新的宏观节点<math>v_{\mu}</math>,得到宏观网络<math>B</math>,将<math>v_j</math>所属的马尔可夫毯中的不在队列中的节点加入队列中,更新集合中节点的马尔可夫毯,如果节点马尔可夫毯中包括<math>v_j</math>节点,则将<math>v_j</math>节点去除 |
| ## EI没增加则继续尝试与队列中的其他节点进行合并,直至队列中的节点都合并过,返回步骤2 | | ## EI没增加则继续尝试与队列中的其他节点进行合并,直至队列中的节点都合并过,返回步骤2 |
| 时间复杂度:<math>O(N^4)</math> | | 时间复杂度:<math>O(N^4)</math> |
第108行: |
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| # 针对邻接矩阵<math>A</math>,得到其[[转移矩阵]]<math>W</math>,然后进行矩阵的[[特征值分解]],得到特征值集合<math>Λ=\{λ_i\}^N_{i=1}</math>与特征向量集合<math>E=\{e_i\}^N_{i=1}</math>,通过去除特征值为0的特征向量并且通过特征值对对应的特征向量进行加权,构建新的有偏的特征向量集合<math>E’=\{λ_ie_i|λ_i≠0\}^N_{i=1}</math>(新的网络节点数量为<math>N'=rank(A)</math>)。直观地说,忽略特征值为0的特征向量是有意义的,因为它对应网络中的简并性,并且非零特征值和相应的特征向量包含了丰富的网络拓扑结构信息; | | # 针对邻接矩阵<math>A</math>,得到其[[转移矩阵]]<math>W</math>,然后进行矩阵的[[特征值分解]],得到特征值集合<math>Λ=\{λ_i\}^N_{i=1}</math>与特征向量集合<math>E=\{e_i\}^N_{i=1}</math>,通过去除特征值为0的特征向量并且通过特征值对对应的特征向量进行加权,构建新的有偏的特征向量集合<math>E’=\{λ_ie_i|λ_i≠0\}^N_{i=1}</math>(新的网络节点数量为<math>N'=rank(A)</math>)。直观地说,忽略特征值为0的特征向量是有意义的,因为它对应网络中的简并性,并且非零特征值和相应的特征向量包含了丰富的网络拓扑结构信息; |
| # 依据<math>E'</math>计算节点间的距离矩阵<math>D_{N'×N'}</math>: | | # 依据<math>E'</math>计算节点间的距离矩阵<math>D_{N'×N'}</math>: |
− | ## 如果节点<math>v_i</math>和<math>v_j</math>分别在对方的邻域中,则通过新的特征向量计算两个节点的cos相似性作为两者间的距离<math>d_{ij}</math>和<math>d_{ji}</math> | + | ## 如果节点<math>v_i</math>和<math>v_j</math>分别在对方的马尔可夫毯中,则通过新的特征向量计算两个节点的cos相似性作为两者间的距离<math>d_{ij}</math>和<math>d_{ji}</math> |
| ## 否则将两个节点间的距离设为无穷大∞(可以设个比较大的值,如10000) | | ## 否则将两个节点间的距离设为无穷大∞(可以设个比较大的值,如10000) |
| # 基于距离矩阵<math>D_{N'×N'}</math>和一个距离超参<math>\epsilon</math>(需要线性搜索,可以选择EI最大的参数),使用[[OPTICS]]算法(是一种基于密度的聚类算法,旨在识别数据集中不同密度的聚类结构)进行聚类,输出对应超参<math>\epsilon</math>下的聚类方式,同一类里的节点进行粗粒化作为一个宏观节点,得到宏观网络<math>B</math> | | # 基于距离矩阵<math>D_{N'×N'}</math>和一个距离超参<math>\epsilon</math>(需要线性搜索,可以选择EI最大的参数),使用[[OPTICS]]算法(是一种基于密度的聚类算法,旨在识别数据集中不同密度的聚类结构)进行聚类,输出对应超参<math>\epsilon</math>下的聚类方式,同一类里的节点进行粗粒化作为一个宏观节点,得到宏观网络<math>B</math> |