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第56行： − 人们在20世纪六七十年代研究出几种研究复杂分子系统的方法，如代谢控制分析和生化系统理论。整个20世纪80年代分子生物学的成功，以及人们对理论生物学的怀疑，加之收获小于预期，使得生物过程的定量模拟成为一个日渐被轻视的领域。+ + + + − 然而，20世纪90年代功能基因组学的诞生意味着人们可以得到大量高质量的数据，同时计算能力爆炸式增长，使得更真实的模型成为可能。1992年至1994年，曾斌撰写系列文章《论人体的全息模型》，第一届全国比较研究会议研究中医和西医，医学和哲学，1992年4月（“系统医学和药理学”称）。《转基因动物表达系统-转基因卵子计划》关于转基因动物的交流，第1卷，第11期；1994（关于系统遗传学和术语杜撰的概念）。曾斌，《自我组织结构理论》，《转基因动物的交流》，曾斌于1996年在中国出版了《系统医学、系统遗传学和系统生物工程》 ，并在北京举行的第一届国际转基因动物会议上作了关于生物系统理论和系统方法研究的演讲。1997年，富田正丸小组发表了第一个关于整个（假设的）细胞新陈代谢的定量模型。+ + + + + +
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理论家[[路德维希·冯·贝塔郎菲 Ludwig von Bertalanffy]]和他的'''<font color="#FF8000">一般系统论 general systems theory</font>'''可以被看作是系统生物学先驱之一。英国神经生理学家、诺贝尔奖获得者艾伦·劳埃德·霍奇金 Alan Lloyd Hodgkin和安德鲁·费尔丁·赫克斯利 Andrew Ferdinand Hoxley在1952年发表了最早的细胞生物学的数理分析之一，他们也创建了一个数学模型，解释了沿神经元细胞轴突传播的动作电位。他们的模型描述了一种由钾和钠两种不同的分子成分之间的相互作用所产生的细胞功能，所以这可以被看作是演算系统生物学的开端。无独有偶，'''艾伦·图灵 Alan Turing'''在1952年发表了形态发生的化学基础，描述了最初同质的生物系统中是如何产生不均匀性的。<ref>{{Cite journal|last1=Turing|first1=A. M.|authorlink=Alan Turing|title=The Chemical Basis of Morphogenesis|journal=Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences|volume=237|issue=641|pages=37–72|doi=10.1098/rstb.1952.0012|url=http://www.dna.caltech.edu/courses/cs191/paperscs191/turing.pdf|jstor=92463|year=1952|pmid=|pmc =|bibcode=1952RSPTB.237...37T}}</ref>
理论家[[路德维希·冯·贝塔郎菲 Ludwig von Bertalanffy]]和他的'''<font color="#FF8000">一般系统论 general systems theory</font>'''可以被看作是系统生物学先驱之一。英国神经生理学家、诺贝尔奖获得者艾伦·劳埃德·霍奇金 Alan Lloyd Hodgkin和安德鲁·费尔丁·赫克斯利 Andrew Ferdinand Hoxley在1952年发表了最早的细胞生物学的数理分析之一，他们也创建了一个数学模型，解释了沿神经元细胞轴突传播的动作电位。他们的模型描述了一种由钾和钠两种不同的分子成分之间的相互作用所产生的细胞功能，所以这可以被看作是演算系统生物学的开端。
无独有偶，'''艾伦·图灵 Alan Turing'''在1952年发表了形态发生的化学基础，描述了最初同质的生物系统中是如何产生不均匀性的。<ref>{{Cite journal|last1=Turing|first1=A. M.|authorlink=Alan Turing|title=The Chemical Basis of Morphogenesis|journal=Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences|volume=237|issue=641|pages=37–72|doi=10.1098/rstb.1952.0012|url=http://www.dna.caltech.edu/courses/cs191/paperscs191/turing.pdf|jstor=92463|year=1952|pmid=|pmc =|bibcode=1952RSPTB.237...37T}}</ref>
人们在20世纪六七十年代研究出几种研究复杂分子系统的方法，如代谢控制分析和生化系统理论。
整个20世纪80年代分子生物学的成功，以及人们对理论生物学的怀疑，加之收获小于预期，使得生物过程的定量模拟成为一个日渐被轻视的领域。
[[File:SystemsBiologyTrendsInMostCitedResearch.png|thumb|不同时间维度生物学论文中被引用频率前30的文章里各个主题的占比，显示了系统生物学研究的趋势<ref>{{Cite journal|last1=Zou|first1=Yawen|last2=Laubichler|first2=Manfred D.|date=2018-07-25|title=From systems to biology: A computational analysis of the research articles on systems biology from 1992 to 2013|journal=PLOS ONE|language=en|volume=13|issue=7|pages=e0200929|doi=10.1371/journal.pone.0200929|issn=1932-6203|pmc=6059489|pmid=30044828|bibcode=2018PLoSO..1300929Z}}</ref>]]
[[File:SystemsBiologyTrendsInMostCitedResearch.png|thumb|不同时间维度生物学论文中被引用频率前30的文章里各个主题的占比，显示了系统生物学研究的趋势<ref>{{Cite journal|last1=Zou|first1=Yawen|last2=Laubichler|first2=Manfred D.|date=2018-07-25|title=From systems to biology: A computational analysis of the research articles on systems biology from 1992 to 2013|journal=PLOS ONE|language=en|volume=13|issue=7|pages=e0200929|doi=10.1371/journal.pone.0200929|issn=1932-6203|pmc=6059489|pmid=30044828|bibcode=2018PLoSO..1300929Z}}</ref>]]
然而，20世纪90年代功能基因组学的诞生意味着人们可以得到大量高质量的数据，同时计算能力爆炸式增长，使得更真实的模型成为可能。1992年至1994年，曾斌撰写系列关于系统医学、系统遗传学和系统生物工程方面的文章<ref>B. J. Zeng, "On the holographic model of human body", 1st National Conference of Comparative
Studies Traditional Chinese Medicine and West Medicine, Medicine and Philosophy, April 1992 ("systems medicine and pharmacology" termed).</ref><ref>Zeng (B.) J., On the concept of system biological engineering, Communication on Transgenic Animals, No. 6, June, 1994.</ref><ref>B. J. Zeng, "Transgenic animal expression system – transgenic egg plan (goldegg plan)",
''Communication on Transgenic Animal'', Vol.1, No.11, 1994 (on the concept of system genetics and term coined).</ref><ref>B. J. Zeng, "From positive to synthetic science", ''Communication on Transgenic Animals'', No. 11, 1995 (on systems medicine).</ref><ref>B. J. Zeng, "The structure theory of self-organization systems", ''Communication on Transgenic Animals'',
No.8-10, 1996. Etc.</ref> on [[systems medicine]], systems genetics, and systems biological engineering by B. J. Zeng was published in China and was giving a lecture on biosystems theory and systems-approach research at the First International Conference on Transgenic Animals, Beijing, 1996. In 1997, the group of [[Masaru Tomita]] published the first quantitative model of the metabolism of a whole (hypothetical) cell.<ref name="tomita97" />，1996年，他在北京举行的第一届国际转基因动物会议上作了关于生物系统理论和系统方法研究的演讲。1997年，富田正丸小组发表了第一个关于整个（假设的）细胞新陈代谢的定量模型。