更改

跳到导航 跳到搜索
删除43字节 、 2024年3月5日 (星期二)
第21行: 第21行:  
Sloppiness在生物学领域最为普遍,但在其它领域也并不缺席。从昆虫飞行模型,到原子间势,再到加速器设计,许多目前常用的模型都是sloppy的。例如,量子蒙特卡洛是求解原子和小分子的能量和量子行为的最精确的工具;然而,赛勒斯·乌姆里加(Cyrus Umrigar)在这种方法基础上建立的非常精确的变分波函数却是极度sloppy(b列)。
 
Sloppiness在生物学领域最为普遍,但在其它领域也并不缺席。从昆虫飞行模型,到原子间势,再到加速器设计,许多目前常用的模型都是sloppy的。例如,量子蒙特卡洛是求解原子和小分子的能量和量子行为的最精确的工具;然而,赛勒斯·乌姆里加(Cyrus Umrigar)在这种方法基础上建立的非常精确的变分波函数却是极度sloppy(b列)。
   −
即便参数值与真实值相差很大,有sloppy特性的模型也可以做出精确的预测。在数学中有一个经典的拟合难题<ref name = “Waterfall et.al, 2006”>”Sloppy model universality class and the Vandermonde matrix", Joshua J. Waterfall, Fergal P. Casey, Ryan N. Gutenkunst, Kevin S. Brown, Christopher R. Myers, Piet W. Brouwer, Veit Elser, and James P. Sethna, Phys. Rev. Letters 97, 150601 (2006), also selected for Virtual Journal of Biological Physics Research 12 (8, Miscellaneous), (2006). </ref><ref name = “Transtrum et.al, 2014”>” Model reduction by manifold boundaries", Mark K. Transtrum, P. Qiu Phys. Rev. Lett. 113, 098701 (2014); pdf. </ref>:用指数衰变和去拟合放射性模型(c列和d列)得到的衰变常数与真实衰变常数截然不同,但短期内模型预测值与真实值却相差不大 。最后,用多项式系数模型<math>\sum_i a_it^i</math>拟合数据是sloppy的(h列)。但用正交多项式基<math>\sum_ib_iH_i</math>(<math>H_i</math>是一组正交多项式基)去拟合时得到的模型却往往是非sloppy的,这是因为从<math>t^i</math>到<math>H_i</math>的变换是高度非正交的<ref name="Transtrum et.al, 2014"/>。
+
即便参数值与真实值相差很大,有sloppy特性的模型也可以做出精确的预测。在数学中有一个经典的拟合难题<ref name = “Waterfall et.al, 2006”>”Sloppy model universality class and the Vandermonde matrix", Joshua J. Waterfall, Fergal P. Casey, Ryan N. Gutenkunst, Kevin S. Brown, Christopher R. Myers, Piet W. Brouwer, Veit Elser, and James P. Sethna, Phys. Rev. Letters 97, 150601 (2006), also selected for Virtual Journal of Biological Physics Research 12 (8, Miscellaneous), (2006). </ref><ref name="Transtrum et.al, 2014">” Model reduction by manifold boundaries", Mark K. Transtrum, P. Qiu Phys. Rev. Lett. 113, 098701 (2014); pdf. </ref>:用指数衰变和去拟合放射性模型(c列和d列)得到的衰变常数与真实衰变常数截然不同,但短期内模型预测值与真实值却相差不大 。最后,用多项式系数模型<math>\sum_i a_it^i</math>拟合数据是sloppy的(h列)。但用正交多项式基<math>\sum_ib_iH_i</math>(<math>H_i</math>是一组正交多项式基)去拟合时得到的模型却往往是非sloppy的,这是因为从<math>t^i</math>到<math>H_i</math>的变换是高度非正交的<ref name="Transtrum et.al, 2014"/>。
   −
Sloppy模型有着多种形式,每个模型的sloppniess的原因并不完全相同,部分系统的sloppiness的原因可以从数学上进行分析。但是不同系统的sloppiniess具体原因仍然极具复杂性<ref name = “Transtrum and Qiu, 2016”> Bridging Mechanistic and Phenomenological Models of Complex Biological Systems, Mark K. Transtrum and Peng Qiu, PLoS Comput Biol 12(5): e1004915. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004915</ref>。
+
Sloppy模型有着多种形式,每个模型的sloppniess的原因并不完全相同,部分系统的sloppiness的原因可以从数学上进行分析。但是不同系统的sloppiniess具体原因仍然极具复杂性<ref> Bridging Mechanistic and Phenomenological Models of Complex Biological Systems, Mark K. Transtrum and Peng Qiu, PLoS Comput Biol 12(5): e1004915. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1004915</ref>。
    
==Sloppy 理论与物理学==
 
==Sloppy 理论与物理学==

导航菜单