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有一个对网络模体的有趣概括:'''活动模体'''是在对节点和边都被量化标准的网络中可发现的【反复】的斑图。例如,当新城代谢的边以相应基因的表达量或【时间】来标注时,一些斑图在'''给定的'''底层网络结构里【是反复的】。<ref name="agc">{{cite journal |vauthors=Chechik G, Oh E, Rando O, Weissman J, Regev A, Koller D |title=Activity motifs reveal principles of timing in transcriptional control of the yeast metabolic network |journal=Nat. Biotechnol. |volume=26 |issue=11 |pages=1251–9 |date=November 2008 |pmid=18953355 |pmc=2651818 |doi=10.1038/nbt.1499}}</ref>
 
有一个对网络模体的有趣概括:'''活动模体'''是在对节点和边都被量化标准的网络中可发现的【反复】的斑图。例如,当新城代谢的边以相应基因的表达量或【时间】来标注时,一些斑图在'''给定的'''底层网络结构里【是反复的】。<ref name="agc">{{cite journal |vauthors=Chechik G, Oh E, Rando O, Weissman J, Regev A, Koller D |title=Activity motifs reveal principles of timing in transcriptional control of the yeast metabolic network |journal=Nat. Biotechnol. |volume=26 |issue=11 |pages=1251–9 |date=November 2008 |pmid=18953355 |pmc=2651818 |doi=10.1038/nbt.1499}}</ref>
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==批判 Criticism==
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==批判==
    
关于拓扑子结构的一个(某种程度上隐含的)前提性假设是其具有特定的功能重要性。但这个假设最近遭到质疑,有人提出在不同的网络环境下模体可能表现出多样性,例如双扇模体,所以<ref name="ad">{{cite journal |vauthors=Ingram PJ, Stumpf MP, Stark J |title=Network motifs: structure does not determine function |journal=BMC Genomics |volume=7 |pages=108 |year=2006 |pmid=16677373 |pmc=1488845 |doi=10.1186/1471-2164-7-108 }} {{open access}}</ref>模体的结构不必然决定功能,网络结构也不当然能揭示其功能;这种见解由来已久,可参见【Sin 操纵子】</font>。<ref>{{cite journal |vauthors=Voigt CA, Wolf DM, Arkin AP |title=The ''Bacillus subtilis'' sin operon: an evolvable network motif |journal=Genetics |volume=169 |issue=3 |pages=1187–202 |date=March 2005 |pmid=15466432 |pmc=1449569 |doi=10.1534/genetics.104.031955 |url=http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15466432}}</ref>
 
关于拓扑子结构的一个(某种程度上隐含的)前提性假设是其具有特定的功能重要性。但这个假设最近遭到质疑,有人提出在不同的网络环境下模体可能表现出多样性,例如双扇模体,所以<ref name="ad">{{cite journal |vauthors=Ingram PJ, Stumpf MP, Stark J |title=Network motifs: structure does not determine function |journal=BMC Genomics |volume=7 |pages=108 |year=2006 |pmid=16677373 |pmc=1488845 |doi=10.1186/1471-2164-7-108 }} {{open access}}</ref>模体的结构不必然决定功能,网络结构也不当然能揭示其功能;这种见解由来已久,可参见【Sin 操纵子】</font>。<ref>{{cite journal |vauthors=Voigt CA, Wolf DM, Arkin AP |title=The ''Bacillus subtilis'' sin operon: an evolvable network motif |journal=Genetics |volume=169 |issue=3 |pages=1187–202 |date=March 2005 |pmid=15466432 |pmc=1449569 |doi=10.1534/genetics.104.031955 |url=http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15466432}}</ref>
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